Çifte Minareli Medrese, il merkezi Tarihi Kent Meydanı’nda bulunmaktadır. Kitabesine göre 1271 yılında Vezir Sahip Şemseddin Muhammed Cüveynî tarafından yaptırılmıştır. Selçuklu döneminin en anıtsal, aynı zamanda en fazla tahribat ve yıkıma uğramış yapılarından biridir. Günümüze sadece doğu cephe ayakta kalmıştır. Medrese uzun süre kapalı kaldıktan sonra, 1882 yılında hastane, daha sonra İnönü mektebi olarak kullanılmıştır.
Yapı iki katlı, dört eyvanlı ve açık avluludur. Doğu yönünde yer alan medrese girişinin taş süslemeli cephesi büyük boyutları ve çifte minaresi ile dikkati çekmektedir. Taç kapı da görülen geometrik, bitkisel süslemeler ile yazı kullanımı ve minarelerinde tuğla-sırlı tuğla örgülü süslemeleri dönemin bezeme dünyasının izlendiği bir örnektir. Medrese eğitimi ile aydınlanılacağının bir sembolü olarak köşe kulelerine kandil içerisindeki mumlar yerleştirilmiştir. 1965-71 yılları arasında yapılan kazı çalışmalarıyla medresenin temelleri ortaya çıkarılmıştır. 2009 yılındaki onarımda temel yükseltilerek, duvar kalıntıları belirgin hâle getirilmiştir.